一些非外科局部肝癌治療方法，包括局部摘除(Local ablation)、經導管動脈化療栓塞法(Transcatheter arterial chemo-embolization，TACE)等。在局部摘除的方法上，它包括腫瘤內純酒精(PEIT)或醋酸注射(PAI)，微波燒灼(Microwave)、無線電頻率燒灼 (Radiofrequency)、雷射、熱探子燒灼(Heater probe)或冷凍療法(Cryotherapy)等。
這些方式的共通原理是利用局部的物理或化學變化造成細胞之壞死，因此比較不會傷害到其他正常的肝功能，它最需要注意的副作用是因穿刺而造成的內出血，故在進行前要事先測定病人的凝血機能，並且盡量避免在有多量腹水的病人身上進行，以減低肝癌治療的風險。可能會有少數的病人在進行治療後發生肝功能惡化的現象，另外也可能因為肝腫瘤本身屬於極易到處轉移的分化不好之肝癌，曾有轉移到下針的途徑(肝表面或皮膚)的實際案例。
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